Pacifique, 1945... L'Empire du Soleil-Levant vient juste de capituler.
Démobilisés, Buck, Sonny et Tumb quittent les "Tigres Volants" et s'apprêtent à rentrer aux États-Unis lorsqu'ils reçoivent une convocation du Général MacArthur les invitant à se rendre à Tokyo pour y être décorés. Pendant ce temps, un bombardier américain B-29, transportant un chargement aussi mystérieux que létal, disparaît corps et bien au beau milieu du Pacifique.
Mais est-ce vraiment un accident ?
Tandis que toute la flotte du Pacifique conduit des recherches aéronavales de grande ampleur pour le retrouver, Buck et ses amis mènent leur enquête à Tokyo, un officier des renseignements militaires les ayant mis sur la piste d'une mystérieuse organisation secrète s'autoproclamant : Les Fantômes du Soleil-Levant. Celle-ci, composée d'officiers renégats refusant de rendre les armes, a juré de se venger des Américains d'une façon si violente que le monde entier en sera ébranlé. Mais, d'autres spectres surgissant du passé guettent nos amis. Buck Danny et ses complices vont devoir les débusquer, aussi bien dans les décombres d'un Tokyo dévasté, qu'au fin fond des îles des Philippines peuplées de réducteurs de tête...