Les équipes du Muséum national d'Histoire naturelle et de l'Office français de la biodiversité mènent depuis plusieurs décennies des
programmes d'études et d'inventaires de la diversité des poissons d'eau douce de France. Ce travail a conduit à une progression considérable des connaissances, notamment grâce aux études moléculaires.

Cette nouvelle édition présente des évolutions importantes :
- des chapitres généraux sur l'écologie, la gestion et la conservation des populations de poissons et des écosystèmes aquatiques d'eau douce ;
- une nouvelle approche de la répartition, avec des cartes de présence basées sur les bassins versants ;
- une présentation des traits de vie des poissons d'eau douce, à jour des connaissances actuelles ;
- des monographies qui présentent chaque espèce, en intégrant les connaissances scientifiques les plus récentes et les nouvelles espèces récemment décrites (12 nouvelles espèces) comme le brochet aquitain, l'épinochette du Poitou, l'ombre d'Auvergne, etc., ainsi que 5 espèces exotiques récemment arrivées en France (saumon à bosse, rotengle italien, gobie à tache noire, etc.).